KEGG enrichmentをしようと

ここの再現をしようとしている。

参照:https://github.com/dgrapov/TeachingDemos/blob/master/Demos/Pathway%20Analysis/KEGG%20Pathway%20Enrichment.md

KEGGRESTのインストールの際に
依存するpngパッケージのインストールで
image not found
でpng.soがないと言われてコケた。

sourceを直接インストールしてもうまくいかず、
Mavericks向けのバイナリーを入れてやっと動いた。


コメント

このブログの人気の投稿

再現性なんてないさ(?)

jupytherにチャレンジ

特に収穫がない日