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jupytherにチャレンジ

前にチャレンジしたんですがpythonをあまり解析に使っていなかったのもあって挫折した

ipython notebook(jupyter)に再びチャレンジ!

(jupyterはipython notebookに独立した名前がついた最新版という認識でよさそう)
https://www.quora.com/What-is-the-difference-between-Jupyter-and-IPython-Notebook



基本的には
> conda install ipython-notebook
> conda install jupyter
でよいと思うんですが
インストールしたあと

> ipython notebook

とコマンドを入れると、
    ImportError: IPython.html requires pyzmq >= 13
とエラーが!pyzmqのバージョンは16なのに!

uninstallなど試してみたがうまくいかず、結局
>  ipython_mac.command

> jupyter notebook
でうまくいくことが判明した。
ipython notebookは古いのかなぁと思うので、とりあえず放置。

TODO
python2.x -> python3.xにできるか実データに試してみるgit管理がうまくできるか

shellのチェック

qsubでジョブを投げると、変数定義のところで


"Commond not found""ttyにアクセスができません"

とかでおった。
シェルもちゃんと定義してるのになんでだ?と思ったら

http://stackoverflow.com/questions/17271931/sge-command-not-found-undefined-variable

そういえば
#$ -S /bin/bash
とか定義しないといけなかった。
スクリプトを新規に書き出すと忘れていけませんね。



qsub中で

echo $0echo $SHELL

としたら案の定cshが走っていた。
cshだと

set hoge=hoge

とかしないといけないので、それは怒られますわヽ(`Д´#)ノ